Nacido castizo (descendiente de un abuelo indígena y 3 abuelos
españoles) entre los años 1568 y 1580,
Fernando de Alva Ixtlilxóchitl fue llamado así en memoria del conquistador de Tenochtitlan, Hernán Cortés (también llamado Hernando
Cortés). Hijo de Juan de Navas Pérez de Peraleda y de Ana Cortés
Ixtlilxóchitl, fue descendiente directo, de los reyes de
Acolhuacan y de Tenochtitlan (su bisabuelo fue Hernando Ixtlilxóchitl),
último tlatoani de Texcoco, también llamado Ixtlilxóchitl II, (hijo de
Yacotzin ; por
lo tanto tataranieto de Nezahualcoyotl), y de Beatriz Papatzin,
hija ésta de Cuitláhuac, antiguo señor de Iztapalapa y último tlatoani de los mexicas en la época de la invasión
española, período en que expulsó a los conquistadores en el episodio conocido
como la Noche Triste, Aparte descendiente de Hernan Cortés. Por
mediado del Arzobispo de México Fray García Guerra, fue
nombrada su familia, noble, y se les dio un pequeño señorío hereditario.
Fue un distinguido alumno del
Colegio de la
Santa Cruz de Tlatelolco, fundado por órdenes del Fraile Juan de Zumárraga, primer obispo de México. En este
sitio fue educado en la lengua náhuatl y en el idioma castellano. Por un tiempo vivió en San Juan Teotihuacan,
entre 1600 y 1604. Ocho años más tarde en 1612,
fue nombrado gobernador indígena de Texcoco, y al año siguiente, del pueblo de Tlalmanalco. Fue el hermano mayor de Bartolomé de Alva Ixtlilxóchitl.
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